Σκοπός της ΕΕΕΟ αποτελεί η προαγωγή της επιστήμης των Οπωροκηπευτικών, η πνευματική εξύψωση των Μελών της και η ανάπτυξη συνεργασίας μεταξύ τους, μέσω επιστημονικών συνεδριάσεων και διαλέξεων. Αποστολή της είναι οι ενέργειες αυτές να έχουν θετικό αντίκτυπο στη γεωργική παραγωγή.

Από τις αρχές της δεκαετίας του ’90 οι Επιστημονικές Συνεδριάσεις αναβαθμίστηκαν και είχαν χαρακτηριστικά Συνεδρίου, διάρκειας 3-4 ημερών με στόχο να διοργανώνονται σε διαφορετική κάθε φορά πόλη της χώρας ανά διετία. Tα Επιστημονικά Συνέδρια της ΕΕΕΟ αποτελούν τον πυρήνα ανάπτυξης και εξέλιξης της Εταιρείας.

Από τα 21 ιδρυτικά Μέλη, η Εταιρεία απαριθμεί περίπου 250 Μέλη σήμερα! Με γεωπονικά λόγια, η Εταιρεία ρίζωσε, μεγάλωσε και πλέον καρποφορεί αειφόρα ατενίζοντας προς το μέλλον. Ο ρόλος των Μελών της στην έρευνα, την εκπαίδευση και την παραγωγή είναι αξιοσημείωτος καθώς οι προκλήσεις είναι πολλές.

Από το 1976 άρχισαν να διοργανώνονται Επιστημονικές Συνεδριάσεις, που διαμορφώθηκαν σε συνεδριακό κλίμα, με ανακοινώσεις ερευνητών από όλο το φάσμα των αντικειμένων των Οπωροκηπευτικών. Επίσης, πραγματοποιούνται Ημερίδες, Συμπόσια, Διαλέξεις καθώς και Σεμινάρια.